Các đặc điểm bên ngoài của tòa nhà hiện đại này, mái nhà giống như biển trong nhiều bức tranh cũ của Nhật Bản, vang vọng cả môi trường xung quanh bảo tàng và một số tác phẩm nghệ thuật bên trong; khu vườn bên cạnh tòa nhà là một món quà của thành phố Kyoto. Đó là một cấu trúc đương đại vừa bổ sung vừa tương phản với nghệ thuật cổ xưa của Nhật Bản, và chứa cả phòng triển lãm và hội nghị. Ngoài các triển lãm thường trực, Trung tâm còn tổ chức các triển lãm tạm thời, chủ yếu liên quan đến nghệ thuật, văn hóa và công nghệ Nhật Bản. Ngoài ra, trung tâm còn tổ chức các khóa học về trà đạo Nhật Bản, ikebana và tiếng Nhật. Manggha là trụ sở của Câu lạc bộ bonsai Ba Lan.